Primer5入門(mén)級(jí)引物設(shè)計(jì)攻略_飛外網(wǎng)

Primer5是分子生物學(xué)常用的引物設(shè)計(jì)軟件,準(zhǔn)確率高,操作性強(qiáng),下面小編就如何利用Primer5進(jìn)行引物設(shè)計(jì)分享自己的心得,本篇較簡(jiǎn)單,適合初學(xué)者。

操作方法01

獲取引物模板引物與模板一一對(duì)應(yīng),設(shè)計(jì)引物之前先要找到一段匹配的模板。以H9禽流感病毒HA基因?yàn)槔?,在NCBI上下載一個(gè)最新的病毒HA基因作為本經(jīng)驗(yàn)所介紹的引物設(shè)計(jì)的模板。

02

新建打開(kāi)Primer5(小編的版本為英文版),依次點(diǎn)擊“file”——“new”——“DNA Sequence”,新建操作界面。

03

輸入模板基因復(fù)制基因模板后,使用鍵盤(pán)快捷鍵“Ctrl+V”將下載的引物模板粘貼到空白框內(nèi),然后選擇“As is”,點(diǎn)擊“OK”。

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Search Primer找到界面左上角“Function”——“?Primer”,在新跳出的界面上點(diǎn)擊“Search”,需要設(shè)置相應(yīng)的條件,才能開(kāi)始搜索。

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條件設(shè)置點(diǎn)擊“Search”后,又跳出一個(gè)界面,我們從上到下依次設(shè)置:“Search For”選擇“PCR Primers”;“Search Type”選擇“Pairs”;“Search Ranges”要根據(jù)不同的情況而定,一般來(lái)說(shuō)選擇基因全長(zhǎng),如“1”——“1683”;“PCR Product Size”一般鑒定選擇300-500,測(cè)序選擇1200-1600,不能超過(guò)基因全長(zhǎng);“Primer Length”一般為20+(-)2。

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點(diǎn)擊兩次“OK”條件設(shè)置完畢后,點(diǎn)擊“OK”,跳出新的界面后再點(diǎn)擊“OK”,最后跳出軟件為你選擇的按照合成率從高到底的全部引物序列。

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引物選擇將引物表與左側(cè)表格結(jié)合起來(lái)進(jìn)行引物的選擇。從小編設(shè)計(jì)的引物表中看到,最高合成率為88,其對(duì)應(yīng)的左側(cè)表中均出現(xiàn)“Dimer”和“Cross Dimer”,說(shuō)明此引物不甚理想。最佳的情況為“Hairpin”、“Dimer”、“False Priming”和“Cross Dimer”都不出現(xiàn),也就是100合成率。

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重新設(shè)置條件如何引物不甚理想,那么就需要重新設(shè)置引物的各個(gè)條件,尤其是“Search Ranges”的選擇,需要我們?cè)俅吸c(diǎn)擊“Search ”,跳出條件設(shè)置界面后重新設(shè)置。

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選擇理想引物經(jīng)過(guò)多次的不斷更改和設(shè)置后,最終選出較為理想的一對(duì)引物,合成率最好在98以上,四種狀況均不出現(xiàn)為好。


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沙盤(pán)游戲在高校心理健康輔導(dǎo)中的作用 隨著沙盤(pán)游戲技術(shù)的發(fā)展,沙盤(pán)游戲治療也逐漸在大學(xué)生心理健康教育中發(fā)揮積極作用。同時(shí),沙盤(pán)游戲包含的整合性與自性化意義,也可以在人格發(fā)展以及心性成長(zhǎng)中發(fā)揮積極的作用。在大學(xué)校園里,沙盤(pán)游戲作為心理輔導(dǎo)與咨詢(xún)的一種方式,更容易被大學(xué)生所接受。
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如何準(zhǔn)備辯論賽 辯論賽主要分為:立論陳詞,攻辯,攻辯小結(jié),自由辯論,總結(jié)陳詞。那么這段時(shí)間應(yīng)該怎么準(zhǔn)備辯論賽呢?通過(guò)視頻對(duì)辯論賽和辯題都有了大致了解后,就要開(kāi)始總結(jié)觀(guān)點(diǎn),而且需要總結(jié)的是雙方觀(guān)點(diǎn)。當(dāng)然,辯論賽的臨場(chǎng)發(fā)揮很重要,但沒(méi)有很好的準(zhǔn)備,絕對(duì)不會(huì)出現(xiàn)一場(chǎng)精彩的辯論。